Az Akadémia elnöke a közalkalmazotti törvénynek megfelelően döntött a főigazgatók és igazgatók személyéről. Eszerint öt kutatóközpontban az eddigi főigazgató folytathatja munkáját, három kutatóközpont és egy kutatóintézet élén pedig 2016. január 1-jétől új vezető áll majd. Az MTA Közgazdaság- és Regionális Tudományi Kutatóközpont főigazgatója 5 évig továbbra is Fazekas Károly.